Bota e futbollit është në zi, ndahet nga jeta Sinisha Mihaljoviç.
Ish-futbollisti dhe trajneri ndërroi jetë në moshën 53-vjeçare nga leucemia akute mieloide. Sëmundja u diagnostikua më 13 korrik 2019, u mposht dhe më pas u kthye në mars 2022.
Tre vjet trajtim, një tranplant i palcës kockore dhe rikthimi në stolin e Bologna-s, përpara se të shkarkohej në shtator.
Mihajloviç ka luajtur për Romën, Sampdorian, Lazion dhe Interin, ka lënë pas gruan e tij Arianna, vajzat Virginia dhe Viktorija dhe djemtë Marco, Miroslav, Dusan dhe Nikolas.